定義不同：房屋所有權初始登記指對未經登記機關確認其房地產權利，領取房地產權利證書的土地使用權及建筑物、 附著物的所有權進行的登記。房屋所有權初始登記多為房款開發企業辦理的，房屋所有權登記是房屋由開發企業轉移到購房者個人名下的登記。
初始登記就是我們常說的“確權”。在房屋竣工以后90日內，由開發商向登記機關申報，經過房屋土地管理部門的審核，確認某一房地產的所有權、使用權的隸屬關系和他項權利。通過確權以后，開發商取得《房屋所有權證》(大產權證)。這個過程只能由開發商來辦。
開發商不進行初始登記，應該承擔違約責任。如果合同中沒有約定違約金的數額，或者損失的數額不好估計，可以參照中國人民銀行規定的金融機構計收逾期貸款利息的標準計算。沒有初始登記，不能辦理個人的《房屋所有權證》。
只有開發商進行初始登記，取得了大產權證以后，購房者才能申請辦理轉移登記，領取個人的《房屋所有權證》。
登記申請表;申請人身份證明(法人及其他組織提交法人委托書、法人代碼證、營業執照復印件、自然人提供身份證復印件);建設用地使用權證明;建設工程符合規劃的證明(規劃許可證或修建許可證、建審圖、施工許可證等);房屋已竣工的證明;房屋測繪報告;其他必要材料。
法律依據：《中華人民共和國物權法》第九條【不動產物權登記生效以及所有權可不登記的規定】不動產物權的設立、變更、轉讓和消滅，經依法登記，發生效力;未經登記，不發生效力，但法律另有規定的除外。依法屬于國家所有的自然資源，所有權可以不登記。
